استتار و اختفا از هنرهای مهم در نین جوتسو نینجا می باشد که نینجا با استفاده از این هنرها به سرعت خود را از دید دشمن پنهان می کند. استتار به معنی همرنگ شدن با محیط و اختفا به معنی پنهان شدن می باشد. یک نینجا باید بیاموزد تا چطور خود را در شرایط اضطراری در سایه درخت ، سایه ی دیوار، زیر پل و.. مخفی کند. یک نینجا باید در موقع ورود به مکانی ابتدا مکانهای قابل پنهان شدن را پیدا و مشخص کند و همینطور محل های ورود و خروج را تحت کنترل داشته باشد تا در موقع نیاز سریعا از دیده ها پنهان شود.